As peças e as cores da Bandeira Municipal apresentam a seguinte simbologia:

- Verde vegetal dos paralelogramas lembra os campos verdejantes e a esperança de boas colheitas

- Faixas diagonais de cor vermelho escuro simbolizam a terra fértil espalhada por todos os quadrantes de seu território

- Azul dos triângulos-retângulos representa a cor do céu nas manhãs de primavera, os rios e o lago de Itaipu que banham o território do município

- Losango branco ao centro significa o território e a população de Missal, simboliza também o espírito da paz e amizade presentes nos corações dos habitantes do município.

- Livro aberto simboliza a Sede Municipal, a fita marcadora do Poder Municipal a guiar os destinos de sua população.